A kollagén egy amfolit, amely két tényezőtől függ: először is, a kollagén peptidlánconként sok savas vagy bázikus oldalcsoportot tartalmaz; másodszor, minden peptidlánc tartalmaz -karboxil- és - aminocsoportokat, amelyek protonokat fogadhatnak el vagy adhatnak át, és egy adott pH-tartományon belül disszociálhatnak, pozitív vagy negatív töltéseket generálva. Más szóval, a tápközeg pH-jával a különböző kollagének pozitív töltésűvé válnak. vagy negatív töltésű ionok. A kollagén peptidláncok oldalsó csoportjainak pKa értékei kismértékben eltérnek az alkotó aminosavak oldalcsoportjaitól, ami a fehérjemolekulában lévő szomszédos töltések hatásának köszönhető. Az izoelektromos pont 7,5-7,8, ami lúgos, mivel a kollagén peptidláncában több bázikus aminosav van, mint savas. Mivel ez egy polimer, kolloid tulajdonságokkal rendelkezik, és vizes oldatban bizonyos viszkozitása van. A viszkozitás az izoelektromos ponton a legalacsonyabb, és minél alacsonyabb a hőmérséklet, annál nagyobb a viszkozitás.
